Хорошо бы стделать возможность объединять метки в иерархию, как это например сделано в программе работы с фотографиями F-spot. Там каждая метка имеет родительскую метку (если она не метка верхнего уровня).

То есть, к примеру, можно иметь метку Путешествия, у которой есть дочерние метки Аргентина и Евразия. У Евразии есть дочерние метки Франция и Бангладеш. Таким образом, можно выводить список закладок по метке Бангладеш, можно по метке Аргентина, а можно по Евразия (будут выведены все закладки Франция и Бангладеш), а можно по метке Путешествия (будут выведены все закладки по метке Франция, Аргентина и Бангладеш.

Это очень удобно. Дополнительное удобство в том, что не нужно при добавлении закладки проставлять вручную все родительские метки, они проставятся автоматически.