http://habrahabr.ru/post/163871/#comment_5637749

Чтобы обойти кеширование и в то же время иметь версию в имени файла придумано достаточно изящное решение в .htaccess

# анти-прокси-кэширование стилей
# style.v123.css -> style.css
RewriteRule ^(.*)∖.v[0-9]+∖.css$ $1.css
RewriteRule ^(.*)∖.v[0-9]+∖.js$ $1.js

* * *

Другой вариант противостояния кешированию. В строке подключения css файла, в атрибуте href после имени файла пишем “?v=версия_файла”.
Пример:

<link rel="stylesheet" media="all" href="..css/style.css?v=1" />

Браузер запоминает этот параметр, и проверяет его при каждом посещении сайта. Если версия файла изменится, стили перезагружаются.

P.S.
Кажется, этот метод не работает. Ищем другой.
Вот ещё два решения:
1.
http://charliepark.tumblr.com/post/5998700883/cache-busting-the-wordpress-stylesheet

"So, I just add a timestamp to the end of the CSS file … exactly how Rails (up to 3.1) did.

<link rel="stylesheet" type="text/css" media="all" href="<?php bloginfo( 'stylesheet_url' ); ?>?<?php echo time(); ?>" />
By adding the last part of that string (?<?php echo time(); ?>), it means that the CSS file is fetched new on each pageload."

2.
http://wordpress.stackexchange.com/questions/5116/cache-busting-css-files-other-than-style-css
(Последний метод, внизу, вроде, доступен.)