С выходом новой Joomla 1.6, разработчики шаблонов для этой CMS, желающие использовать в своем шаблоне не стандартную javascript библиотеку, такую например как jQuery или тот же mootools, но более ранней версии (в joomla 1.6 используется mootools 1.3), или более свежие версии библиотеки mootools, столкнутся с той же проблемой что и в joomla 1.5.

http://cleverscript.ru/index.php/cms/joomla/35-clear-script-joomla