Напомним, что действие игры разворачивается за год до событий «Тени Чернобыля». Группа лихих Сталкеров подобралась вплотную к сердцу Зоны - Чернобыльской АЭС и спровоцировала катастрофу. В результате произошел сильный выброс аномальной энергии, изменивший привычную всем Зону почти до неузнаваемости. Пропали огромные участки земли, старые и знакомые дороги оказались заблокированы, а где-то появились целые уровни, о коих ничего не было известно ранее.